Popülarite, güvenlik sorunlarını da beraberinde getiriyor. Şirket, uygulamayı kullanıcılar daha güvenli ve düzenli tutmak için birtakım politikalar yürütüyor. Bunlara uymayan kişilere ise WhatsApp’tan bir süreliğine, hatta kalıcı şekilde yasaklanma cezaları verilebiliyor.